บูจินกัน โดโจ ถูกตั้งขึ้นเมื่อกลางยุค 70 โดยมี 9 ริว (Styles) ในการฝึกโดยมีสามริวเป็นนินจุสสึ และ อีกหกริวเป็นศิลปะการต่อสู้โบราณ Togakure-ryu Ninpo Happo Biken ถูกก่อตั้งประมาณกลางยุค 1100 โดย Daisuke Nishina เป็นวิชาที่เก่าแก่ที่สุดอันดับที่สองของบูจินกัน โดดเด่นในเรื่องของนินจุสสึ และ การใช้อาวุธ เช่น Shuko,, Shuriken ในบางตำราเชื่อว่าเป็นวิชาที่มีส่วนเกี่ยวข้องกับของอิกะเนื่องจากในผู้ สืบทอดของ โตกาคุเระ ริวมีหลายท่านที่มาจากตระกูลนินจาที่อยู่ในหุบเขาของอิกะ เช่น ตระกูลอิกะ ตระกูลอูเอโน และ ตระกูลโทดะ (อาจารย์ทากามัสซึเป็นเชื้อสายคนสุดท้ายของตระกูลโทดะ) Kukishin-ryu Taijutsu Happo Biken ถูกก่อตั้งขึ้นในกลางยุค 1300 โดย Izumo Kanja Yoshitero เป็นหนึ่งในวิชาที่มีเนื้อวิชาจำนวนมาก ทั้งด้านการต่อสู้มือเปล่า ในด้านการใช้อาวุธต่าง ๆ และ เทคนิคการต่อสู้ในชุดเกราะ ทั้งตัวคุคิชินริว เองก็ยังมีสาขาแยกย่อยออกไปอีกมากที่ไม่ เกี่ยวข้องกับบูจินกัน นอกจากนี้วิชาคุคิชินริวในอดีต ยังมีความสัมพันธ์กับวิชาการต่อสู้อื่น ๆ อย่างเช่น อาจารย์ฮุเอชิบาของไอคิโดก็เคยฝึก เทคนิคการใช้ พลองกับคุคิชิน (ไม่ใช่สายเดียวกับบูจินกัน) หรือ อาจารย์จิโกโร คาโน ก็ได้เรียนท่าฮิซ่า กุรุมา มาจากอาจารย์ทากามัสซึ Shindenfudo-ryu Dakentaijutsu Happo Biken ถูกก่อตั้งในปลายยุค 1100 โดย Izumo Kaja Yoshitero มีชื่อเสียงในด้าน Dakentaijutsu และ เทคนิคการใช้ร่างกาย ชินเด็นฟุโดริวจะใช้ร่างกาย การเคลื่อนไหวมากกว่ากำลัง หัวใจ ของชินเดน ฟุโดริวก็คือการเข้าใจถึงธรรมชาติเป็นหนึ่ง ในวิชาที่อยู่ในระดับสูงของบูจินกัน Gyokushin-ryu Ninpo Happo Biken ถูกก่อตั้งขึ้นประมาณยุค 1500 โดย Sasaki Goemon Teruyoshi เป็นวิชานินจุสสึโดยทั่วไปคล้ายคลึง กับโตคากุเระริว ไม่ถูกแยกออกมาพูดถึงมากนัก ที่เห็นเด่นชัดก็คือการใช้ Kusari fundo นอกจากนั้นในวิชาที่เกี่ยวข้องกันอาจารย์มาซึอะกิ ยัง ได้รับ Menkyo Kaiden ของ Gyokushin-ryu Koppou-jutsu จากอาจารย์อูเอโน ทาคาชิ ผู้สืบทอดลำดับที่สิบสี่ของ Gyokushin-ryu Koppou-jutsu ก่อนที่จะได้พบอาจารย์ทากามัสซึอีกด้วย Koto-ryu Koppojutsu Happo Biken ถูกก่อตั้งขึ้นกลางยุค 1500 โดย Sakagami Taro Kunishige มือชื่อเสียงในเรื่องของ การจู่โจมจุดอ่อน การจู่โจมกระดูก และ วิธีการใช้ดาบ เป็นหนึ่งในวิชาที่มีชื่อเสียงของนินจา ในประวัติศาสตร์ญี่ปุ่น ซันดายุ โมโมชิ(Sandayu Momochi) หนึ่งในผู้สืบทอดของ Koto ryu และ Gyokko ryu เป็นหนึ่งในกลุ่มผู้นำกลุ่มนินจาที่เข้าปกป้องหมู่บ้านจากการกวาดล้างหมู่บ้านนินจาของโอดะ โนบุนากะ Gikan-ryu Koppo Taijutsu Happo Biken ถูกก่อตั้งขึ้นกลางยุค 1500 โดย Uryu Hangan Gikanbo เป็นที่รู้จักกันในเรื่องการตั้งท่าที่ใช้ใน ไทจุสสึ และ Koppojutsu ในความสัมพันธ์กับวิชาอื่น ๆ นั้น ผู้สืบทอดลำดับที่สิบสี่ของกิคัน ริว ชื่ออะกิโมโต ฟุมิโอะ ได้สอนท่าการโจมตี และการเตะให้กับ"มิฟุเนะ"ของโคโดกัน ซึ่งถูกตัดออกไป จากการใช้แข่งขันในภายหลัง (ยังพอหาดูได้จากตำราโบราณ) Takagiyoshin-ryu Jutaijutsu Happo Biken ถูกก่อตั้งขึ้นเมื่อต้นยุค 1600 โดย Takagi Oriuemon Shigenobu โดดเด่นในเรื่องของเทคนิคยูยิสสู ที่รวดเร็ว รุนแรง การโจมตีจุดอ่อนและเรื่อง Daisho sabaki เป็นเทคนิคการใช้ดาบ นอกจากนี้โดนเด่นในเรื่องการป้องกันตัว การต่อสู้ด้วย มือเปล่ากับมือเปล่า การต่อสู้ด้วยมือเปล่ากับอาวุธ การต่อสู้จากท่านั่งเป็นเทคนิคการต่อสู้ของซามูไร Kumogakure-ryu Ninpo Happo Biken ถูกก่อตั้งในกลางยุค 1500 โดย Iga Heinaizaemon No Jo Ienaga ถูกแสดงออกมาโดยมากในเรื่อง Kamayari และ เทคนิคการกระโดด คำว่า "Shikin Haramitsu Daikomyou" มาจาก คุโมกาคุเระ ริว นี่เอง